آموزش شبیه سازی روند کلونینگ و PCR با نرم افزار اسنپ ژن SnapGene

نرم افزار اسنپ ژن SnapGene چیست؟ 

یکی از نرم‌افزارهای کاربردی در زیست‌شناسی که در شبیه‌سازی روند کلون‌سازی ژن‌ها و طراحی کاربرد دارد، نرم‌افزار اسنپ ژن است.
 از کاربردهای این نرم‌افزار می‌توان به طراحی و شبیه‌سازی توالی ژنتیکی، مدیریت دنباله‌های ژنتیکی، شبیه‌سازی کنترل ترجمه، تحلیل توالی ژنتیکی و… اشاره کرد.

اهمیت یادگیری شبیه‌سازی روند کلونینگ و PCR با نرم‌افزار اسنپ ژن SnapGene چیست؟ 

دست‌ورزی‌های ژنتیکی ابزاری قدرتمند در اختیار ژنتیک‌دانان قرار داده است تا مولکول‌های هدف را برای رسیدن به اهداف گوناگون ویرایش کرده و ویژگی‌های جدیدی را به آن‌ها اضافه نمایند. لازمه گام برداشتن در این مسیر، مطالعات بیوانفورماتیکی قوی بوده که با کمک نرم‌افزارهای مختلف قابل انجام است.

شبیه‌سازی روند کلون‌سازی با نمایش شماتیک اجزای مولکول ناقل، جایگاه درج قطعه مورد نظر و نیز محل قرارگیری باندها بر روی ژل، به پژوهشگران در پیش‌بینی نتیجه هر مرحله از فرایند کلون‌سازی کمک می‌کند.

در این فرادرس چه چیزی یاد می‌گیریم؟ 

در این فرادرس با معرفی نرم‌افزار اسنپ ژن (SnapGene) مخاطبان با روند کلی شبیه‌سازی فرایند کلونینگ و کاربردهای آن در مهندسی ژنتیک آشنا می‌شوند.

سرفصل‌ها

• درس یکم: معرفی اسنپ ژن (SnapGene) و نشانه گذاری توالی
  • وارد کردن توالی مورد نظر و بررسی اولیه آن
  • نشانه گذاری توالی براساس ویژگی های ساختاری
  • شبیه سازی PCR و دیدن باندها بر روی ژل
• درس دوم: آشنایی با منوی Enzyme
  • وارد کردن توالی وکتور و نشانه گذاری آن
  • شبیه سازی Digestion و Ligation
• درس سوم: شبیه سازی انواعی از روش های کلونینگ (Cloning)
  • روش گیبسون (Gibson)
  • روش گیت وی
• درس چهارم: آنالیز توالی ها با اسنپ ژن
  • آنالیز توالی های حاصل از Sequencing (پیدا کردن نویزها و جهش ها)
  • ذخیره کردن اطلاعات